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Biological Computing I (C1)

 

Semester: Fall 2008, TIGP-BP
Place
: Institute of Information Science, Academia Sinica, New Building, Rm. 107
Time: Friday Afternoons,  2:00-5:00 PM
Topic:

Reference: Neil C. Jones and Pavel A. Pevzner, An Introduction to Bioinformatics Algorithms, MIT Press, 2004

 

 

Week

Date

Topics

Lecturers

Slides

Online

Others

1

2008/09/19

Analysis of Algorithms

Wen-Lian Hsu

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2

2008/09/26

Programming Primer

Chia-Yu Su

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3

2008/10/03

Recurrence

 

Wen-Lian Hsu

 

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4

2008/10/08

(Wed.)2-5pm

Introduction to Data Structure I

@Rm.306

 

Chi-Jen Lu

 

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5

2008/10/17

Introduction to Data Structure II

Chi-Jen Lu 

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6

2008/10/24

Algorithmic Techniques 

Wen-Lian Hsu

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7

2008/10/31

Motif Finding

Ting-Yi Sung

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8

  2008/11/07  

Review week

 

 

 

 

9

2008/11/14

Midterm Exam

 

 

 

 

10

2008/11/21

Pairwise Sequence Alignment

 

Huai-Kuang Tsai 

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11

2008/11/26

(Wed.)2-5pm

Multiple Sequence Alignment

@Rm.306

 

Huai-Kuang Tsai 

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12

2008/12/10

(Wed.)9-12am

Graph Algorithms (I)

Wen-Lian Hsu

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13

2008/12/12

 

Graph Algorithms (II)

 

Wen-Lian Hsu

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14

2008/12/19

Combinatorial Pattern Matching 

Kun-Pin Wu 

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15

2008/12/26

Suffix Trees

Kun-Pin Wu 

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16

2008/12/31 

(Wed.)2-5pm

Genome Evolution and Phylogenetic Trees @Rm.306

 

Chun-Chieh Shih 

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17

2009/01/09

Programming Review

Chia-Yu Su

 

 

 

18

2009/01/16

Final Exam

 

 

 

 

 

 

Bioinformatics Program, TIGP , Academia Sinica , Taiwan c 2004 - 2005